Il complesso fu realizzato secondo i voleri testamentari del Cardinale Mercurino Arborio Gattinara, tra il 1530 e il 1542 (data riportata sulla parete interna del lato est fra due tavelle in cotto). L’edificio residenziale dei canonici situato sul lato orientale si articola su due piani; gli altri tre lati del chiostro formano un porticato che collega la chiesa. La parte occidentale del complesso fu parzialmente inglobata nei locali accessori della sacrestia e in parte demolita per dare spazio al coro della nuova chiesa. Le colonne in pietra portano capitelli scolpiti di pregevole fattura e di forme diverse.
